Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 TTTY14-204ENST00000452584 860 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PGPEP1Q9NXJ5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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PGPEP1Q9NXJ5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PGPEP1Q9NXJ5 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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PGPEP1Q9NXJ5 AC007919.2-201ENST00000444110 511 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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