Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOR4AQ9NXH8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms