Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC25Q9NXE8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms