Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
ERVK13-1Q9NX77 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms