Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCIQ9NVI1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCIQ9NVI1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCIQ9NVI1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCIQ9NVI1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCIQ9NVI1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCIQ9NVI1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCIQ9NVI1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCIQ9NVI1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCIQ9NVI1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCIQ9NVI1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCIQ9NVI1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCIQ9NVI1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCIQ9NVI1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCIQ9NVI1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCIQ9NVI1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCIQ9NVI1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCIQ9NVI1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCIQ9NVI1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms