Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF275Q9NSD4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms