Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms