Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB6BQ9NRW1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms