Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD8

UBE2T, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 T, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2TQ9NPD8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2TQ9NPD8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBE2TQ9NPD8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBE2TQ9NPD8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBE2TQ9NPD8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2TQ9NPD8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms