Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS5

EPB41L4A, Band 4.1-like protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L4AQ9HCS5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41L4AQ9HCS5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPB41L4AQ9HCS5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPB41L4AQ9HCS5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPB41L4AQ9HCS5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41L4AQ9HCS5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41L4AQ9HCS5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41L4AQ9HCS5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41L4AQ9HCS5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41L4AQ9HCS5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41L4AQ9HCS5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41L4AQ9HCS5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41L4AQ9HCS5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41L4AQ9HCS5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41L4AQ9HCS5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41L4AQ9HCS5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41L4AQ9HCS5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41L4AQ9HCS5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41L4AQ9HCS5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41L4AQ9HCS5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41L4AQ9HCS5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41L4AQ9HCS5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41L4AQ9HCS5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41L4AQ9HCS5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41L4AQ9HCS5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB41L4AQ9HCS5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB41L4AQ9HCS5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB41L4AQ9HCS5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB41L4AQ9HCS5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB41L4AQ9HCS5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB41L4AQ9HCS5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB41L4AQ9HCS5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB41L4AQ9HCS5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB41L4AQ9HCS5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms