Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms