Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms