Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms