Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms