Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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