Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms