Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms