Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms