Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms