Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PUS3Q9BZE2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms