Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GSDMCQ9BYG8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms