Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAPERQ9BY12 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAPERQ9BY12 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAPERQ9BY12 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAPERQ9BY12 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAPERQ9BY12 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAPERQ9BY12 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAPERQ9BY12 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAPERQ9BY12 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAPERQ9BY12 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAPERQ9BY12 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAPERQ9BY12 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAPERQ9BY12 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAPERQ9BY12 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAPERQ9BY12 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAPERQ9BY12 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAPERQ9BY12 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SCAPERQ9BY12 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SCAPERQ9BY12 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SCAPERQ9BY12 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SCAPERQ9BY12 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms