Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms