Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms