Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR3CQ9BUI4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms