Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms