Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms