Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SCAF11Q99590 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF11Q99590 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms