Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PKP4Q99569 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms