Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms