Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms