Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBP4Q96PP9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms