Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms