Protein–RNA interactions for Protein: Q96N53

LINC00167, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00167, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00167Q96N53 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00167Q96N53 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms