Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF4Q96M43 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms