Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms