Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms