Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms