Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms