Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EDC3Q96F86 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EDC3Q96F86 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms