Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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SGF29Q96ES7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SGF29Q96ES7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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