Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms