Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP3Q96DZ5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms