Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms