Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113Q902F9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms