Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWW8

GAB3, GRB2-associated-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAB3Q8WWW8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GAB3Q8WWW8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms