Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAU0

NKX2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-3Q8TAU0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX2-3Q8TAU0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX2-3Q8TAU0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms