Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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