Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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