Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms